PayPal начислява такса за спор на търговец, за да управлява процеса за разрешаване на спорове за трансакции, които са били завършени от купувач с акаунт в PayPal или купувач, използващ PayPal финализиране като гост. 

Тази такса за спор се прилага както за трансакции, при които купувачът предявява претенция директно към PayPal, така и когато подава заявка за обратно начисление към издателя на картата си или за сторниране към банката си. 

Таксата за спор не се прилага за трансакции, обработени чрез PayPal Pro или чрез разширени опции за кредитни и дебитни карти, които понякога се наричат "небрандирани трансакции". 

Сумата на таксата за спор зависи от процента подадени претенции спрямо общите ви продажби през предходните 3 месеца. Прилага се стандартната такса за спор, освен ако вашата честота на оспорване е над 1,5% или имате повече от 100 трансакции за продажби през предходните три пълни месеца. Ако попадате в тази категория, за всеки спор ще се прилага таксата за спор с висок обем .  

Стандартната такса за спор се отменя за запитвания в Центъра за разрешаване на проблеми на PayPal, които не са ескалирани до претенция, и които са разрешени по взаимно съгласие между купувача и продавача или тези, които са подадени до PayPal директно като неразрешена трансакция.